涉密文件的管理包括收文、发文和日常管理三个主要环节。销毁清退文件，指将办结文件退还原发文单位或由其指定的其他单位。公文处理的核心部分是收文处理，而收文处理的第四阶段（处置办毕文件）当中包括文件的清退、立卷、归档、销毁等内容。在公文处理过程中，一般平件可以不清退，领导和有关部门可自行销毁；秘密以上密级的公文必须清退到公文处理有关部门统一处理，然后根据规定进行立卷和归档，经整理后，视情况对部分公文进行销毁。