蝇类防治核心是管控孳生物，垃圾、厨余废料、腐败有机物是苍蝇主要繁殖场所。所有垃圾容器必须加盖，做到日产日清，定期清洗垃圾桶，清除桶壁残留残渣。垃圾房、下水道、化粪池周边是重点检查区域，及时清理散落污物，减少产卵环境。物理防蝇设施包含纱门纱窗、防蝇帘、风幕机、灭蝇灯、捕蝇笼。灭蝇灯安装远离食品加工区，高度符合规范，定期清理粘捕虫体，避免滋生二次污染。捕蝇笼放置在室外垃圾周边，使用诱饵引诱成蝇。
化学防治分为滞留喷洒与空间喷雾。对苍蝇停留的墙面、立柱、垃圾站墙面做滞留喷洒，形成长效药膜；蝇密度爆发时，采用空间喷雾快速降低成蝇数量。药剂选用登记合格卫生杀虫剂，严格按照配比稀释，做好个人防护。施药避开食物、餐具。持续清理卫生死角，减少腐败物堆积，降低蝇类持续繁殖能力，巩固消杀效果。
