无酸档案盒的防护效果，高度依赖库房环境，脱离合适环境，依然会加速老化。最关键是温湿度控制，湿度偏高，纸张容易吸潮发霉，碱性缓冲剂也会加速流失；环境过于干燥，纸张纤维失水变脆，翻阅时容易断裂。
库房要避免阳光直射，紫外线是纸张老化的重要诱因，阳光长时间照射，无酸纸也会褪色、强度下降。远离热源、空调出风口，冷热反复交替会加速材料老化。同时保持库房洁净，减少粉尘，粉尘带有酸性杂质，落在盒面、盒内，慢慢侵蚀纸张。
档案盒摆放时，不要紧贴墙面、地面，利用档案柜隔绝地面潮气，柜与柜之间预留通风通道。档案盒竖立摆放，不要长期重压堆叠，多层堆叠会压垮盒体，盒内文件受压粘连。定期巡检库房，发现盒体受潮、长霉及时隔离处理，无酸材料只是延缓老化，不能隔绝霉菌、虫害的侵害。
