有机肥翻堆机堆肥堆积发酵期间由于微生物的作用会产生高热，即堆肥的温度会随堆积时间而增高，升高至一定温度后便不再上升，然而堆肥溫度持续保持。
堆肥堆体积太小溫度不易上升，体积过大如不勤于翻堆时也容易造成厌氧发酵
在材料混拌时同时添加水分，水分含量大约为60%(手握紧材料时水会渗出，但不会滴下)，再利用一般堆肥方式堆积。利用一般堆肥制作方式堆积时堆积期间若水分不足应添加适量水分。
有机材料除非过于粗糙有碍堆积发酵作业 (如稻草、树枝等)，若非特殊不粉碎为宜。
有机肥翻堆机在工作过程中将肥料及添加剂混合搅拌，达到翻倒、供氧指标后，并把翻倒完的有机肥抛掷到设备后面进行发酵及微生物繁殖。