专为运输要求保持一定温度的冷冻货或低温货而设计的集装箱。它分为带有冷冻机的内藏式机械冷藏集装箱和没有冷冻机的外置式机械冷藏集装箱。适用装载肉类、水果等货物。冷藏集装箱造价较高，营运费用较高，使用中应注意冷冻装置的技术状态及箱内货物所需的温度。
机械式冷藏集装箱
机械式冷藏集装箱是指设有制冷装置（如压缩式制冷机组、吸收式制冷机组等）的冷藏集装箱。机械式冷藏集装箱是技术最为成熟、应用最为广泛的冷藏集装箱，与其他冷藏集装箱相比，它具有以下优点：
①调温范围广，从常温到一30℃左右都能调节。通用性强，能运输不同温度要求的货物；
②自动控制方便；
③箱内温度分布较均匀：
④适宜远距离运输，这是其相对于其他形式冷藏集装箱的最突出的优点。
冷藏集装箱可用于多种交通运输工具进行联运
可以从产地到销售点，实现“国到国”直达运输，
一定条件下，可以当作活动式冷库使用
使用中可以整箱吊装，装卸效率高，运输费用相对较低。
装载容积利用率高，营运调度灵活，使用经济性强。
新型冷藏集装箱结构和技术性能更合理先进，有广泛适用性。
根据ISO/TC-104 668 Dimensions and ratings标准的规定，按照集装箱的长度，集装箱可以分为10‘，20’，30‘，40’，45‘，30’集装箱一般不使用，使用最多的长度尺寸为20‘和40’的集装箱，而且生产制造的集装箱95%以上为长度40'的集装箱。最近几年，45‘集装箱的使用越来越多，所以在2005年换版时把该尺寸的集装箱加入了该标准。