另外一种是夹套冷藏集装箱，这种冷藏集装箱的特点是沿着箱壁有一个供冷空气循环的通道——夹套。这种冷藏集装箱的优点是货物的装载不影响空气的循环，因而不影响温度的分布；其次，夹套空间的全部容积都用于装载货物，这一点对装运低密度的货物是非常有利的。这种集装箱不能装有呼吸的货物，一般用来装运冻结货物。
制冷加热集装箱
制冷加热集装箱是指设有制冷装置（机械式制冷或耗用制冷剂制冷）和加热装置的冷藏集装箱。这种集装箱不仅有制冷装置，而且具有加热装置，可以根据需要采取制冷或加热手段，使冷藏集装箱内的温度控制在所设定的范围内，一般箱内控制温度范围为一18℃～38℃。
耗用冷剂式冷藏集装箱
耗用冷剂式冷藏集装箱泛指各种无须外接电源或燃料供应的冷藏集装箱，包括水冰冷藏集装箱、干冰冷藏集装箱、液氮冷藏集装箱、液体空气冷藏集装箱、液体二氧化碳冷藏集装箱、冷板式冷藏集装箱等。耗用冷剂式冷藏集装箱的特点是在运输过程中，不需要外接电源或燃料供应，无任何运动部件，维修保养要求低。主要缺点是无法实现连续制冷，储冷剂放热和消耗后必须重新充冷或补充，较难实现的温度控制，制冷设备占用空间较大。耗用冷剂式冷藏集装箱主要适用于小型冷藏集装箱的短距离运输。耗用冷剂式冷藏集装箱只在区域性短途冷藏运输中尚有使用，而在国际冷藏运输中已无使用并有逐步被淘汰的趋势。
冷藏集装箱运送冻结货时通常使用温度应不高于-18℃。通常英尺冷冻集装箱，平均降温速度为31.3℃ /h（空箱）；但装货后，由于货物热容量较大，降温速度会大大减慢，有时达到设定温度要求需要15-16h。若进货温度较高，则达到设定温度需要2-3d。