冷藏集装箱（Reefer container）是指一种有良好隔热，且能维持一定低温要求，适用于各类易腐食品的运送、贮存的特殊集装箱。
冷藏集装箱的基本类型有保温集装箱、外置式冷藏集装箱、内藏式冷藏集装箱、液氮和干冰冷藏集装箱、冷冻板冷藏集装等。
机械式冷藏集装箱也有一些缺点：如设备复杂、初始投资大、维修费用高；箱内温度梯度要大于液氮冷藏集装箱；箱内需设风机、风道系统，会增加箱内货物的干耗、脱水。
隔热集装箱的特点是箱体本身结构简单，箱体货物有效装载容积率高，造价便宜。适合大批量、同品种冷冻或冷藏货物在固定航线上运输。其缺点是缺少灵活性，对整个运输线路上的相关配套设施要求高。
根据ISO/TC-104 668 Dimensions and ratings标准的规定，按照集装箱的长度，集装箱可以分为10‘，20’，30‘，40’，45‘，30’集装箱一般不使用，使用最多的长度尺寸为20‘和40’的集装箱，而且生产制造的集装箱95%以上为长度40'的集装箱。最近几年，45‘集装箱的使用越来越多，所以在2005年换版时把该尺寸的集装箱加入了该标准。